自106年起，環保署為落實污染者付費精神，畜牧業應繳交水污染防治費。嘉義縣轄區內列管事業單位及下水道系統中，以畜牧業為主要行業，占總行業別一半以上，處理後之畜牧廢水仍含有肥分可供農地使用，降低河川污染程度，就降低農地土壤引灌受污染河水的機會。
嘉義縣環保局基於畜牧糞尿具高有機質，厭氧發酵後之沼渣沼液糞尿可作為農地肥分使用，推廣農民可參考將厭氧處理之畜牧廢水，直接施用於農田作為肥料，一來減少原本廢水排放至溪水所造成之污染負荷，二來增加原本農地土壤肥分並減少肥料施用量，三來節省原本應繳交的水污染防治費及廢水處理設施操作維護費，可達到維護農地土壤肥力並兼顧地面水體承受力之多贏效果。
畜牧糞尿沼液沼渣澆灌農田計畫施行至今，嘉義縣已有數家業者提出申請，符合規定之畜牧業者，可檢具沼渣沼液農地肥分使用計畫，向農業主管機關提出申請，經農業主管機關同意後，並向環保機關報備，即可再利用畜牧廢棄資源，共同降低河川污染，回歸農地作為肥分使用，創造嘉義綠色循環新經濟。