環境部為推動畜牧糞尿資源再利用，於104年11月24日修正發布「水污染防治措施及檢測申報管理辦法」，訂定「沼液沼渣農地肥分使用」專章，畜牧糞尿經厭氧發酵後即可作為肥分施灌農地，後續於108年3月8日修正為鼓勵小型畜牧業(養豬隻未滿200頭)採行畜牧糞尿資源化處理措施，將沼液沼渣農地肥分使用資料，納入廢（污）水管理計畫申請，並明定飼養豬隻或牛隻畜牧業應採行畜牧糞尿資源化處理措施及應符合之比率，同時簡化申請流程，加速審核通過，以持續提升畜牧糞尿資源化成效。讓畜牧業者除可以節省廢水處理設施第三階段好氧處理之操作經費、減少或免繳水污染防治費外，若為全量施灌，無廢水排出，則無需擔心放流水超標會被開罰，而農民亦可以減少購買化學肥料之費用，同時創造多元經濟效益，以達成「田肥水清」及環境永續之多贏。

嘉義縣環保局今(113)年同積極推動畜牧資源化政策，輔導畜牧場設置沼氣發電系統，不僅解決臭味與廢水問題，也可將綠電賣給台電公司，期以有效解決養豬業者糞尿污水問題。亦於113年3月14日配合「世界水資源日」舉辦「嘉義縣畜牧糞尿集中資源化處理啟動典禮」，並邀請嘉義縣的大家長-縣長 翁章梁、嘉義縣環保局的大家長-局長 張輝川、環境部副司長 羅仁鈞、本次實施畜牧糞尿集中資源化處理之黃科翔畜牧場代表、六腳鄉公所鄉長、嘉義縣養豬事業發展協會理事長、縣府農業處、立委、議員、16家畜牧場代表、巡守隊及工業技術研究院材料與化工研究所等一同共襄盛舉，此外，環保局內計畫-畜牧及土水攜手合作，於現場共同展示土壤、地下水定期監測作業等相關設備，期有效宣導施灌農地地下水水質、土壤品質之污染預防與定期監測作業，一起掌握守護田地土壤品質。

嘉義縣環保局表示，為了推動畜牧資源化政策循環經濟趨勢及農地土壤、地下水監管，地方環保單位配合環境部除與畜牧場媒合並進行畜牧糞尿資源再利用推動外，並於土壤及地下水監管上，透過現場展示土壤、地下水採樣分析流程海報、土壤手動採樣器、地下水微洗井採樣設備及手持式XRF分析儀等土壤、地下水定期監測作業相關設備，以利宣導沼液沼渣農地實施前後，皆須關注之土壤品質及地下水品質監測，一同達到田肥水清，守護咱嘉。